Міхаіл Сяргеевіч Качаткоў нарадзіўся ў 1900 годзе на заводзе Цірлянскі Верхнеўральскага павета Арэнбургскай губерніі. У Чырвонай Арміі служыў з 1919 года. Кадравы афіцэр. Член РКП (б) з 1920 года. У 1932 году Міхаіл Качаткоў скончыў Выведвальныя курсы ўдасканалення старэйшага і сярэдняга каманднага складу пры разведвальным упраўленні. Вучыўся завочна ў Ваеннай акадэміі. Міхаіл Сяргеевіч Качаткоў быў палітруком роты 9-га стралковага Каўказскага палка, памочнікам начальніка штаба 23-га стралковага палка.